一、校内基地
1.南京医科大学第一附属医院研究基地
2.南京医科大学第二附属医院研究基地
3.南京医科大学第三附属医院研究基地
4.南京医科大学第四附属医院研究基地
5.南京医科大学附属口腔医院研究基地
6.南京医科大学附属南京医院研究基地
7.南京医科大学附属脑科医院研究基地
8.南京医科大学附属南京儿童医院研究基地
9.南京医科大学附属南京妇幼保健院研究基地
10.南京医科大学附属眼科医院研究基地
11.南京医科大学附属明基医院研究基地
12.南京医科大学附属肿瘤医院研究基地
13.南京医科大学附属江宁医院研究基地
14.南京医科大学附属常州二院医院研究基地
15.南京医科大学附属常州妇幼保健院研究基地
16.南京医科大学附属江苏盛泽医院研究基地
17.南京医科大学附属上海松江区医院研究基地
18.南京医科大学附属杭州医院研究基地
19.南京医科大学附属淮安医院研究基地
20.南京医科大学附属无锡精神卫生中心研究基地
21.南京医科大学附属无锡妇幼保健院研究基地
22.南京医科大学附属无锡二院研究基地
23.南京医科大学附属无锡人民医院研究基地
24.南京医科大学附属苏州医院研究基地
25.南京医科大学附属友谊整形外科医院研究基地
二、校外基地
1.上海第一人民医院研究基地
2.上海十院临床医学研究基地
3.南京鼓楼地区医患纠纷调解研究基地
4.湖南南华大学第一附属医院研究基地
5.苏州吴中人民医院研究基地
6.张家港市第一医院研究基地