第二，医疗机构的管理体制和运行机制导致医生和患者存在经济利益冲突。现在，各级政府对医院的投入平均只有医院支出的7%左右，有些大医院只占2%～3%，有的甚至要求医院上缴部分收入。医生的工资福利待遇、医院的基本建设和设备购置基本上都靠医疗服务创收解决。这种体制实际上把医患双方推到经济利益对立的地位。医生增加收入，患者就会增加负担；而减轻患者负担，医生就会减少收入。这是体制机制造成的医患矛盾。在战胜疾病问题上，医生和患者的目标是一致的。而在经济利益上，医患双方又存在着冲突。有些医生过分看重个人或医院利益，忽视了群众利益，甚至发生损害群众利益的行为。这固然有少数医生个人的思想和道德问题，但主要是体制机制上的原因，不能单纯责怪医生，更不能动辄用“黑心”、“白眼狼”等谩骂词语。
第三，医患之间缺乏理解和沟通。患者得病，承担着生理、心理和经济的三重负担，特别希望得到医生的同情和帮助。有些医生对患者面临的困难缺乏必要的体谅和关爱，就会引起患者的不满和误解。而有些患者对医生的辛苦缺乏应有的信任和理解，对医疗的风险和医学技术的局限性也缺乏必要的认识。一些患者认为，自己住到医院花了钱，医生就应该治好他的病，治不好就是医生的责任。实际上，医疗服务不同于其他领域服务的显著特点就是风险性大，花钱多少与治疗效果不一定有必然联系。因为医疗服务是一个探索性很强的工作，由于人体存在着客观差异，即便医生尽职尽责，对相同的病采取同样规范的治疗方法，也可能出现不同的结果。特别是对一些危重疑难病症，医学上还有许多没有攻克的难题。有的患者花了很多钱，未能达到期望的治疗效果，就容易迁怒于医生。这就需要做科学的鉴定，如果是医生玩忽职守，应该严肃追究责任；如果医生没有责任，则应该实事求是地加以保护。
构建医患和谐政府负有重要责任
构建和谐医患关系，必须要深入分析导致医患关系紧张的主要原因，采取综合性的措施，逐步化解不和谐因素，不断增加和谐因素，绝不能激化矛盾，增加医患对立。对此，政府负有重要“中间人”的职责。主要措施是：第一，深化医药卫生管理体制机制改革，通过加大政府投入、转换机制和加强监管，强化公立医院的公共服务职能，维护医院的公益性质，帮助医生从创收的桎梏中解脱出来，心无旁骛地为患者服务，逐步消除医患之间的利益冲突；第二，推进医疗卫生事业科学发展，调整医疗资源，优化服务结构，大力发展农村和城市社区卫生，实现患者合理分流，减少大医院门诊数量，集中精力从事疑难复杂病人的救治，扩大医疗服务有效供给，缓解医患双方的供需矛盾；第三，加强对医务人员的思想道德教育，严格医疗服务监管。医生有责任忠诚地为患者提供良好服务，绝不能损害人民群众利益；第四，加强医疗卫生知识宣传教育，引导广大患者正确认识医疗服务的特点和规律。患者有责任尊重医学，尊重医生的辛勤劳动，学会用法律维护权益，自觉维护医疗服务秩序。
处理医疗纠纷必须坚持依法维护医患双方的权益。首先，要把维护人民群众的利益放在第一位，努力保障群众能够享受到安全、廉价、方便、有效的医疗服务；同时，也要维护医生的合法权益和合理收入，为医生创造良好的执业环境和服务环境，不能“又要马儿跑，又让马儿不吃草”。